Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc125Q5U465 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc125Q5U465 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc125Q5U465 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc125Q5U465 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc125Q5U465 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110 ms