Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC181Q5TID7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms