Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ulk3Q3U3Q1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ulk3Q3U3Q1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms