Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf6Q3TWW8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.8 ms