Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc10Q3TLI0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms