Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA9Q16790 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA9Q16790 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA9Q16790 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA9Q16790 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA9Q16790 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA9Q16790 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA9Q16790 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA9Q16790 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA9Q16790 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA9Q16790 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA9Q16790 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA9Q16790 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA9Q16790 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA9Q16790 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA9Q16790 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA9Q16790 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA9Q16790 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CA9Q16790 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CA9Q16790 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CA9Q16790 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA9Q16790 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA9Q16790 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA9Q16790 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA9Q16790 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA9Q16790 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA9Q16790 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA9Q16790 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA9Q16790 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA9Q16790 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA9Q16790 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA9Q16790 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA9Q16790 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA9Q16790 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA9Q16790 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA9Q16790 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA9Q16790 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA9Q16790 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CA9Q16790 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CA9Q16790 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CA9Q16790 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CA9Q16790 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CA9Q16790 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CA9Q16790 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CA9Q16790 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CA9Q16790 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA9Q16790 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA9Q16790 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA9Q16790 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA9Q16790 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA9Q16790 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA9Q16790 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CA9Q16790 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA9Q16790 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA9Q16790 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA9Q16790 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA9Q16790 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA9Q16790 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA9Q16790 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA9Q16790 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA9Q16790 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA9Q16790 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CA9Q16790 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA9Q16790 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA9Q16790 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA9Q16790 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA9Q16790 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA9Q16790 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CA9Q16790 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA9Q16790 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA9Q16790 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA9Q16790 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CA9Q16790 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CA9Q16790 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA9Q16790 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA9Q16790 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA9Q16790 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA9Q16790 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA9Q16790 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA9Q16790 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA9Q16790 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA9Q16790 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA9Q16790 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA9Q16790 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA9Q16790 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA9Q16790 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA9Q16790 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA9Q16790 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA9Q16790 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA9Q16790 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA9Q16790 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA9Q16790 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA9Q16790 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA9Q16790 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA9Q16790 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA9Q16790 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA9Q16790 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA9Q16790 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA9Q16790 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CA9Q16790 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
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