Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIGQ13278 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIGQ13278 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIGQ13278 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIGQ13278 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIGQ13278 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIGQ13278 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIGQ13278 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RIGQ13278 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIGQ13278 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIGQ13278 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIGQ13278 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIGQ13278 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIGQ13278 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIGQ13278 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIGQ13278 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIGQ13278 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIGQ13278 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIGQ13278 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIGQ13278 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIGQ13278 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIGQ13278 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIGQ13278 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIGQ13278 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIGQ13278 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIGQ13278 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIGQ13278 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIGQ13278 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIGQ13278 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIGQ13278 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIGQ13278 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIGQ13278 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIGQ13278 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIGQ13278 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIGQ13278 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIGQ13278 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIGQ13278 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RIGQ13278 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RIGQ13278 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIGQ13278 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIGQ13278 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIGQ13278 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIGQ13278 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIGQ13278 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIGQ13278 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIGQ13278 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIGQ13278 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIGQ13278 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIGQ13278 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIGQ13278 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIGQ13278 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIGQ13278 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIGQ13278 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIGQ13278 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIGQ13278 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIGQ13278 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIGQ13278 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIGQ13278 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIGQ13278 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIGQ13278 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIGQ13278 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIGQ13278 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIGQ13278 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIGQ13278 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIGQ13278 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIGQ13278 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIGQ13278 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIGQ13278 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIGQ13278 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIGQ13278 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIGQ13278 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIGQ13278 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIGQ13278 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIGQ13278 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RIGQ13278 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIGQ13278 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIGQ13278 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIGQ13278 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIGQ13278 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIGQ13278 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIGQ13278 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIGQ13278 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIGQ13278 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIGQ13278 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIGQ13278 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIGQ13278 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIGQ13278 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIGQ13278 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIGQ13278 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIGQ13278 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIGQ13278 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RIGQ13278 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIGQ13278 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIGQ13278 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIGQ13278 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIGQ13278 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIGQ13278 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIGQ13278 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIGQ13278 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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