Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF3Q13114 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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