Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdf9Q07105 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdf9Q07105 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdf9Q07105 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.2 ms