Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE1BQ01064 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms