Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
rp9P97762 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
rp9P97762 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
rp9P97762 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
rp9P97762 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
rp9P97762 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
rp9P97762 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
rp9P97762 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
rp9P97762 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
rp9P97762 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
rp9P97762 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
rp9P97762 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
rp9P97762 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
rp9P97762 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
rp9P97762 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
rp9P97762 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
rp9P97762 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
rp9P97762 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
rp9P97762 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
rp9P97762 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
rp9P97762 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
rp9P97762 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
rp9P97762 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
rp9P97762 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
rp9P97762 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
rp9P97762 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
rp9P97762 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
rp9P97762 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
rp9P97762 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
rp9P97762 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
rp9P97762 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
rp9P97762 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
rp9P97762 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
rp9P97762 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
rp9P97762 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
rp9P97762 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
rp9P97762 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
rp9P97762 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
rp9P97762 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
rp9P97762 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
rp9P97762 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
rp9P97762 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
rp9P97762 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
rp9P97762 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
rp9P97762 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
rp9P97762 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
rp9P97762 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
rp9P97762 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
rp9P97762 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
rp9P97762 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
rp9P97762 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
rp9P97762 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
rp9P97762 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
rp9P97762 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
rp9P97762 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
rp9P97762 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
rp9P97762 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
rp9P97762 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
rp9P97762 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
rp9P97762 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
rp9P97762 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
rp9P97762 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
rp9P97762 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
rp9P97762 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
rp9P97762 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
rp9P97762 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
rp9P97762 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
rp9P97762 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
rp9P97762 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
rp9P97762 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
rp9P97762 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
rp9P97762 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
rp9P97762 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
rp9P97762 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
rp9P97762 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
rp9P97762 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
rp9P97762 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
rp9P97762 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
rp9P97762 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
rp9P97762 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
rp9P97762 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
rp9P97762 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
rp9P97762 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
rp9P97762 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
rp9P97762 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
rp9P97762 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
rp9P97762 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
rp9P97762 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
rp9P97762 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
rp9P97762 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
rp9P97762 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
rp9P97762 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
rp9P97762 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
rp9P97762 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
rp9P97762 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
rp9P97762 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
rp9P97762 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
rp9P97762 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
rp9P97762 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
rp9P97762 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms