Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2IP78347 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2IP78347 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms