Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP1P59025 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP1P59025 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP1P59025 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP1P59025 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP1P59025 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP1P59025 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP1P59025 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP1P59025 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP1P59025 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP1P59025 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP1P59025 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP1P59025 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP1P59025 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP1P59025 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP1P59025 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP1P59025 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP1P59025 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP1P59025 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP1P59025 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP1P59025 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RTP1P59025 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTP1P59025 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTP1P59025 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTP1P59025 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTP1P59025 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTP1P59025 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP1P59025 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP1P59025 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP1P59025 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP1P59025 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP1P59025 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP1P59025 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP1P59025 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP1P59025 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP1P59025 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP1P59025 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP1P59025 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP1P59025 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP1P59025 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP1P59025 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP1P59025 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP1P59025 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP1P59025 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP1P59025 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP1P59025 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP1P59025 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP1P59025 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP1P59025 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP1P59025 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP1P59025 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTP1P59025 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTP1P59025 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTP1P59025 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RTP1P59025 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTP1P59025 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTP1P59025 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP1P59025 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP1P59025 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP1P59025 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP1P59025 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP1P59025 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP1P59025 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP1P59025 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP1P59025 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP1P59025 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP1P59025 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP1P59025 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP1P59025 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP1P59025 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP1P59025 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP1P59025 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP1P59025 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP1P59025 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP1P59025 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP1P59025 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP1P59025 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP1P59025 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP1P59025 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP1P59025 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP1P59025 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP1P59025 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP1P59025 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP1P59025 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP1P59025 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP1P59025 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP1P59025 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP1P59025 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP1P59025 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP1P59025 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP1P59025 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP1P59025 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP1P59025 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP1P59025 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP1P59025 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP1P59025 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP1P59025 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP1P59025 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP1P59025 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP1P59025 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.3 ms