Protein–RNA interactions for Protein: P48757

Gast, Gastrin, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GastP48757 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GastP48757 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GastP48757 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GastP48757 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GastP48757 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GastP48757 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GastP48757 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GastP48757 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GastP48757 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GastP48757 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GastP48757 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GastP48757 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GastP48757 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GastP48757 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GastP48757 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GastP48757 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GastP48757 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GastP48757 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GastP48757 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GastP48757 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GastP48757 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GastP48757 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GastP48757 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GastP48757 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GastP48757 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GastP48757 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GastP48757 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GastP48757 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GastP48757 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GastP48757 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GastP48757 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GastP48757 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GastP48757 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GastP48757 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GastP48757 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GastP48757 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GastP48757 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GastP48757 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GastP48757 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GastP48757 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GastP48757 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GastP48757 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GastP48757 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GastP48757 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GastP48757 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GastP48757 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GastP48757 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GastP48757 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GastP48757 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GastP48757 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GastP48757 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GastP48757 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GastP48757 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GastP48757 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GastP48757 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GastP48757 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GastP48757 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GastP48757 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GastP48757 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GastP48757 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GastP48757 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GastP48757 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GastP48757 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GastP48757 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GastP48757 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GastP48757 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GastP48757 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GastP48757 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GastP48757 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GastP48757 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GastP48757 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GastP48757 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GastP48757 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GastP48757 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GastP48757 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GastP48757 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GastP48757 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GastP48757 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GastP48757 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GastP48757 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GastP48757 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GastP48757 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GastP48757 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GastP48757 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GastP48757 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GastP48757 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GastP48757 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GastP48757 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GastP48757 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GastP48757 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GastP48757 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GastP48757 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GastP48757 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GastP48757 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GastP48757 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GastP48757 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GastP48757 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GastP48757 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GastP48757 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GastP48757 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms