Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CSNK1A1P48729 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSNK1A1P48729 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms