Protein–RNA interactions for Protein: P41272

Cd27, CD27 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd27P41272 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd27P41272 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd27P41272 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd27P41272 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd27P41272 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd27P41272 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd27P41272 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd27P41272 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd27P41272 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd27P41272 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd27P41272 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd27P41272 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd27P41272 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd27P41272 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.2 ms