Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5cP41230 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Kdm5cP41230 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm5cP41230 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms