Protein–RNA interactions for Protein: P37172

Acvr1, Activin receptor type-1, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1P37172 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Acvr1P37172 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acvr1P37172 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms