Protein–RNA interactions for Protein: P30935

Sstr3, Somatostatin receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr3P30935 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sstr3P30935 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sstr3P30935 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms