Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tacr1P30548 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tacr1P30548 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms