Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERCC5P28715 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC5P28715 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms