Protein–RNA interactions for Protein: P26368

U2AF2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF2P26368 KIF23-203ENST00000395392 3357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.673e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CBX1-203ENST00000402583 578 ntTSL 410.76□□□□□ -0.693e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 RPS3-215ENST00000530170 531 ntTSL 510.63□□□□□ -0.713e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 FGFR1OP-204ENST00000488525 349 ntTSL 510.37□□□□□ -0.753e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 SNAP25-AS1-201ENST00000421143 808 ntTSL 510.37□□□□□ -0.753e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 RBBP5-202ENST00000367164 4290 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.773e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 KIF23-201ENST00000260363 3713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.83e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 TBCCD1-205ENST00000446782 2186 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.833e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 RPS3-207ENST00000526608 710 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.843e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 TBCCD1-201ENST00000338733 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.863e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.933e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 VANGL1-204ENST00000369510 8647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.943e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 FAM204A-206ENST00000469758 1170 ntTSL 59.07□□□□□ -0.963e-6■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.963e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CORO1C-208ENST00000547294 566 ntTSL 59.04□□□□□ -0.962e-10■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 GTF2E2-204ENST00000522833 752 ntTSL 38.99□□□□□ -0.973e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 RBBP5-201ENST00000264515 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.973e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CORO1C-213ENST00000550032 547 ntTSL 28.73□□□□□ -1.012e-10■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CORO1C-215ENST00000551044 567 ntTSL 38.56□□□□□ -1.042e-10■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.093e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 TBCCD1-203ENST00000424280 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.13e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CORO1C-207ENST00000547170 804 ntTSL 48.18□□□□□ -1.12e-10■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 HPS5-207ENST00000537258 1275 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.113e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 FAM204A-207ENST00000470476 1000 ntTSL 57.55□□□□□ -1.23e-6■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 SEL1L-203ENST00000554744 602 ntTSL 37.47□□□□□ -1.213e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 RSPRY1-207ENST00000563073 699 ntTSL 36.81□□□□□ -1.323e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 RSPRY1-209ENST00000564530 3361 ntTSL 26.73□□□□□ -1.333e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.343e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 HPS5-209ENST00000544218 759 ntTSL 35.9□□□□□ -1.463e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.543e-6■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 ZNF224-207ENST00000591511 538 ntTSL 25.29□□□□□ -1.563e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.583e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 ZFYVE16-207ENST00000510995 2873 ntTSL 1 (best)4.84□□□□□ -1.633e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 EDRF1-212ENST00000527655 851 ntTSL 34.74□□□□□ -1.653e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 HPS5-210ENST00000545561 1121 ntTSL 24.72□□□□□ -1.653e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 GPATCH2-204ENST00000485274 343 ntTSL 34.53□□□□□ -1.683e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.693e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 KDSR-209ENST00000589592 688 ntTSL 34.17□□□□□ -1.743e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 GPATCH2-203ENST00000470014 442 ntTSL 33.58□□□□□ -1.843e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 SLC4A7-217ENST00000475120 770 ntTSL 23.34□□□□□ -1.873e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 YWHAE-206ENST00000496706 732 ntTSL 33.22□□□□□ -1.893e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 STT3B-205ENST00000462235 801 ntTSL 32.75□□□□□ -1.974e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 PTEN-203ENST00000472832 644 ntTSL 22.17□□□□□ -2.063e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.79□□□□□ -2.123e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 FAM204A-210ENST00000491416 576 ntTSL 21.71□□□□□ -2.143e-6■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 TBCCD1-206ENST00000479590 483 ntTSL 31.71□□□□□ -2.143e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.672e-6■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CHFR-202ENST00000315585 2446 ntTSL 217.22■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 CHFR-201ENST00000266880 11133 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 TNS2-208ENST00000549311 5004 ntTSL 517.72■□□□□ 0.436e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.276e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.086e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.076e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.076e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 TNS2-204ENST00000546602 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.126e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 TNS2-210ENST00000549700 4525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.146e-7■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.142e-8■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.712e-8■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.72e-8■■■■■ 27.8
U2AF2P26368 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.71e-323■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 RALGAPA1-215ENST00000556839 1305 ntTSL 35.66□□□□□ -1.51e-8■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 STK11IP-210ENST00000475396 2251 ntTSL 216.7■□□□□ 0.265e-6■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.035e-6■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 STK11IP-203ENST00000456857 578 ntTSL 515.11■□□□□ 0.015e-6■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 STK11IP-205ENST00000459692 854 ntTSL 514.64□□□□□ -0.075e-6■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 STK11IP-208ENST00000468584 574 ntTSL 312.15□□□□□ -0.465e-6■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 TMX3-202ENST00000443099 913 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 TMX3-210ENST00000569053 940 ntTSL 1 (best)11.87□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 TMX3-201ENST00000299608 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 TMX3-206ENST00000564631 1509 ntTSL 1 (best)5.33□□□□□ -1.562e-6■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.292e-6■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.964e-6■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.734e-6■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 AREL1-202ENST00000469797 2196 ntTSL 516.48■□□□□ 0.234e-6■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 AREL1-214ENST00000556589 846 ntTSL 216.37■□□□□ 0.214e-6■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 AREL1-210ENST00000555249 581 ntTSL 316.24■□□□□ 0.194e-6■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.074e-6■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 AREL1-212ENST00000556202 2639 ntTSL 515.47■□□□□ 0.074e-6■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 AREL1-201ENST00000356357 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.214e-6■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 AREL1-216ENST00000557401 3598 ntTSL 511.95□□□□□ -0.54e-6■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 AREL1-206ENST00000553279 706 ntTSL 510.65□□□□□ -0.74e-6■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 AREL1-211ENST00000555330 4855 ntTSL 59.63□□□□□ -0.874e-6■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.084e-6■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.134e-6■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 ARHGAP29-205ENST00000552844 3439 ntTSL 1 (best)2.34□□□□□ -2.034e-6■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 SMAD1-203ENST00000502342 262 ntTSL 31.04□□□□□ -2.244e-6■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.613e-6■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.743e-6■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 ADAM9-205ENST00000481058 516 ntTSL 52.95□□□□□ -1.942e-9■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 RPL37-206ENST00000511787 435 ntTSL 314.47□□□□□ -0.098e-8■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.521e-17■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 CDC27-203ENST00000526866 1420 ntTSL 220.21■□□□□ 0.834e-9■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 UBE2Q1-207ENST00000497453 830 ntTSL 520.12■□□□□ 0.811e-17■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 CDC27-209ENST00000532893 515 ntTSL 315.66■□□□□ 0.14e-9■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 CDC27-210ENST00000533415 2570 ntTSL 215.53■□□□□ 0.084e-9■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 CDC27-217ENST00000575483 781 ntTSL 515.3■□□□□ 0.044e-9■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 CDC27-205ENST00000528147 463 ntTSL 415.3■□□□□ 0.044e-9■■■■■ 27.7
U2AF2P26368 CDC27-202ENST00000525495 1459 ntTSL 513.32□□□□□ -0.284e-9■■■■■ 27.7
Retrieved 100 of 36,523 protein–RNA pairs in 672.8 ms