Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA4P22748 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA4P22748 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA4P22748 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA4P22748 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA4P22748 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA4P22748 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA4P22748 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA4P22748 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA4P22748 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA4P22748 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA4P22748 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA4P22748 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA4P22748 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA4P22748 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA4P22748 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA4P22748 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CA4P22748 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CA4P22748 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA4P22748 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA4P22748 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA4P22748 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA4P22748 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA4P22748 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA4P22748 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA4P22748 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA4P22748 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA4P22748 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CA4P22748 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA4P22748 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA4P22748 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA4P22748 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA4P22748 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA4P22748 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CA4P22748 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA4P22748 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA4P22748 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA4P22748 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA4P22748 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA4P22748 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA4P22748 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA4P22748 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA4P22748 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA4P22748 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA4P22748 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA4P22748 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA4P22748 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA4P22748 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CA4P22748 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA4P22748 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CA4P22748 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA4P22748 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA4P22748 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA4P22748 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CA4P22748 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CA4P22748 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CA4P22748 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CA4P22748 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CA4P22748 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CA4P22748 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CA4P22748 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CA4P22748 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CA4P22748 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CA4P22748 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CA4P22748 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CA4P22748 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CA4P22748 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CA4P22748 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CA4P22748 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CA4P22748 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CA4P22748 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CA4P22748 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CA4P22748 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CA4P22748 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CA4P22748 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CA4P22748 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CA4P22748 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CA4P22748 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CA4P22748 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CA4P22748 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CA4P22748 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CA4P22748 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CA4P22748 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CA4P22748 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CA4P22748 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CA4P22748 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CA4P22748 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CA4P22748 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CA4P22748 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CA4P22748 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CA4P22748 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CA4P22748 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CA4P22748 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CA4P22748 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CA4P22748 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CA4P22748 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CA4P22748 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CA4P22748 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CA4P22748 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CA4P22748 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.4 ms