Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spi1P17433 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Spi1P17433 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spi1P17433 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spi1P17433 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spi1P17433 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spi1P17433 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms