Protein–RNA interactions for Protein: P0DP60

Lynx1, Ly-6/neurotoxin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lynx1P0DP60 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lynx1P0DP60 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lynx1P0DP60 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lynx1P0DP60 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lynx1P0DP60 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lynx1P0DP60 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lynx1P0DP60 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lynx1P0DP60 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lynx1P0DP60 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lynx1P0DP60 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lynx1P0DP60 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lynx1P0DP60 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lynx1P0DP60 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lynx1P0DP60 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lynx1P0DP60 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lynx1P0DP60 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lynx1P0DP60 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lynx1P0DP60 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lynx1P0DP60 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lynx1P0DP60 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lynx1P0DP60 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lynx1P0DP60 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lynx1P0DP60 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lynx1P0DP60 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms