Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx8O88983 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx8O88983 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stx8O88983 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx8O88983 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx8O88983 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx8O88983 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx8O88983 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms