Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dll3O88516 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dll3O88516 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dll3O88516 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dll3O88516 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dll3O88516 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Dll3O88516 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dll3O88516 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dll3O88516 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dll3O88516 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126 ms