Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KDM4AO75164 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM4AO75164 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms