Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Vamp4O70480 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vamp4O70480 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vamp4O70480 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms