Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.714e-7■■■■■ 29
DKC1O60832 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.716e-7■■■■■ 29
DKC1O60832 EHMT1-219ENST00000626066 1297 ntTSL 518.99■□□□□ 0.634e-7■■■■■ 29
DKC1O60832 PRDM15-214ENST00000491486 520 ntTSL 317.38■□□□□ 0.375e-6■■■■■ 29
DKC1O60832 PISD-212ENST00000473770 2378 ntTSL 517.3■□□□□ 0.367e-12■■■■■ 29
DKC1O60832 PISD-217ENST00000491342 692 ntTSL 516.88■□□□□ 0.297e-12■■■■■ 29
DKC1O60832 PISD-205ENST00000429683 609 ntTSL 316.81■□□□□ 0.287e-12■■■■■ 29
DKC1O60832 PISD-206ENST00000431201 460 ntTSL 416.81■□□□□ 0.287e-12■■■■■ 29
DKC1O60832 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.286e-7■■■■■ 29
DKC1O60832 EHMT1-250ENST00000637977 2167 ntTSL 516.74■□□□□ 0.274e-7■■■■■ 29
DKC1O60832 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.47■□□□□ 0.237e-12■■■■■ 29
DKC1O60832 PRDM15-213ENST00000489661 856 ntTSL 316.26■□□□□ 0.195e-6■■■■■ 29
DKC1O60832 PRDM15-216ENST00000496124 435 ntTSL 316.24■□□□□ 0.195e-6■■■■■ 29
DKC1O60832 EHMT1-251ENST00000638071 1710 ntTSL 516.07■□□□□ 0.164e-7■■■■■ 29
DKC1O60832 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.135e-6■■■■■ 29
DKC1O60832 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.137e-12■■■■■ 29
DKC1O60832 PISD-210ENST00000442379 722 ntTSL 215.64■□□□□ 0.097e-12■■■■■ 29
DKC1O60832 PRDM15-204ENST00000433067 6124 ntTSL 515.16■□□□□ 0.025e-6■■■■■ 29
DKC1O60832 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.016e-7■■■■■ 29
DKC1O60832 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.025e-6■■■■■ 29
DKC1O60832 PRDM15-206ENST00000447016 4992 ntTSL 1 (best)14.81□□□□□ -0.045e-6■■■■■ 29
DKC1O60832 PISD-211ENST00000460723 2534 ntTSL 1 (best)14.75□□□□□ -0.057e-12■■■■■ 29
DKC1O60832 EHMT1-201ENST00000371394 2679 ntTSL 214.38□□□□□ -0.114e-7■■■■■ 29
DKC1O60832 PISD-203ENST00000397500 2194 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.137e-12■■■■■ 29
DKC1O60832 PXK-208ENST00000477308 1610 ntTSL 1 (best)13.53□□□□□ -0.246e-7■■■■■ 29
DKC1O60832 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.287e-12■■■■■ 29
DKC1O60832 PISD-208ENST00000437808 2264 ntTSL 513.11□□□□□ -0.317e-12■■■■■ 29
DKC1O60832 EHMT1-221ENST00000629335 3600 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.384e-7■■■■■ 29
DKC1O60832 EHMT1-228ENST00000636027 3114 ntTSL 512.56□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 29
DKC1O60832 PISD-204ENST00000422020 1015 ntTSL 512.46□□□□□ -0.417e-12■■■■■ 29
DKC1O60832 PISD-207ENST00000435900 1723 ntTSL 512.34□□□□□ -0.437e-12■■■■■ 29
DKC1O60832 PRDM15-202ENST00000398548 6654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.545e-6■■■■■ 29
DKC1O60832 PRDM15-208ENST00000449395 6662 ntTSL 1 (best)11.65□□□□□ -0.545e-6■■■■■ 29
DKC1O60832 PISD-201ENST00000266095 2655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.567e-12■■■■■ 29
DKC1O60832 PRDM15-205ENST00000441787 6542 ntTSL 1 (best)11.31□□□□□ -0.65e-6■■■■■ 29
DKC1O60832 PRDM15-203ENST00000422911 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.625e-6■■■■■ 29
DKC1O60832 EHMT1-237ENST00000637261 4208 ntTSL 510.88□□□□□ -0.674e-7■■■■■ 29
DKC1O60832 AC009093.6-201ENST00000622268 553 ntBASIC9.52□□□□□ -0.897e-12■■■■■ 29
DKC1O60832 INPP5D-208ENST00000472517 527 ntTSL 38.63□□□□□ -1.031e-8■■■■■ 29
DKC1O60832 INPP5D-212ENST00000493078 401 ntTSL 58.41□□□□□ -1.061e-8■■■■■ 29
DKC1O60832 NECTIN3-207ENST00000485506 314 ntTSL 24□□□□□ -1.777e-12■■■■■ 29
DKC1O60832 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.666e-8■■■■■ 29
DKC1O60832 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.049e-8■■■■■ 28.9
DKC1O60832 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.049e-8■■■■■ 28.9
DKC1O60832 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.839e-8■■■■■ 28.9
DKC1O60832 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.779e-8■■■■■ 28.9
DKC1O60832 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.589e-8■■■■■ 28.9
DKC1O60832 PRELID3A-206ENST00000589565 777 ntTSL 318.04■□□□□ 0.489e-8■■■■■ 28.9
DKC1O60832 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.069e-7■■■■■ 28.8
DKC1O60832 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.086e-8■■■■■ 28.8
DKC1O60832 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.129e-7■■■■■ 28.8
DKC1O60832 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.166e-8■■■■■ 28.8
DKC1O60832 PTPRK-203ENST00000368207 4758 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.229e-7■■■■■ 28.8
DKC1O60832 PTPRK-221ENST00000532331 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.369e-7■■■■■ 28.8
DKC1O60832 PTPRK-216ENST00000524481 3157 ntTSL 212.74□□□□□ -0.379e-7■■■■■ 28.8
DKC1O60832 PTPRK-205ENST00000368213 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.459e-7■■■■■ 28.8
DKC1O60832 PTPRK-217ENST00000524534 2441 ntTSL 512.07□□□□□ -0.489e-7■■■■■ 28.8
DKC1O60832 PTPRK-206ENST00000368215 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.939e-7■■■■■ 28.8
DKC1O60832 CUX1-218ENST00000560541 3176 ntTSL 511.82□□□□□ -0.521e-8■■■■■ 28.8
DKC1O60832 CUX1-217ENST00000558836 2965 ntTSL 511.43□□□□□ -0.581e-8■■■■■ 28.8
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DKC1O60832 NOP58-202ENST00000426814 655 ntTSL 216.18■□□□□ 0.183e-19■■■■■ 28.8
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DKC1O60832 NOP58-209ENST00000492688 571 ntTSL 44.08□□□□□ -1.763e-19■■■■■ 28.8
DKC1O60832 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 28.8
DKC1O60832 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 28.8
DKC1O60832 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 28.8
DKC1O60832 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 28.8
DKC1O60832 CHD8-210ENST00000555962 1232 ntTSL 510.03□□□□□ -0.81e-18■■■■■ 28.7
DKC1O60832 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.94□□□□□ -1.31e-18■■■■■ 28.7
DKC1O60832 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.951e-6■■■■■ 28.6
DKC1O60832 GREB1-210ENST00000628795 438 ntTSL 55.04□□□□□ -1.63e-7■■■■■ 28.6
DKC1O60832 TMEM74B-203ENST00000481747 582 ntTSL 231.74■■■□□ 2.675e-17■■■■■ 28.6
DKC1O60832 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.027e-11■■■■■ 28.6
DKC1O60832 GIT2-217ENST00000551455 2014 ntTSL 218.64■□□□□ 0.575e-17■■■■■ 28.6
DKC1O60832 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.535e-17■■■■■ 28.6
DKC1O60832 TMEM74B-202ENST00000429036 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.87■□□□□ 0.455e-17■■■■■ 28.6
DKC1O60832 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.417e-11■■■■■ 28.6
DKC1O60832 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.395e-17■■■■■ 28.6
DKC1O60832 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.085e-17■■■■■ 28.6
DKC1O60832 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.035e-17■■■■■ 28.6
DKC1O60832 GIT2-204ENST00000361006 5444 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.445e-17■■■■■ 28.6
DKC1O60832 GIT2-203ENST00000355312 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.495e-17■■■■■ 28.6
DKC1O60832 GIT2-214ENST00000550186 1977 ntTSL 211.91□□□□□ -0.55e-17■■■■■ 28.6
DKC1O60832 GIT2-209ENST00000547815 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.535e-17■■■■■ 28.6
DKC1O60832 GIT2-216ENST00000551209 2127 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.585e-17■■■■■ 28.6
DKC1O60832 GIT2-205ENST00000457474 5291 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.725e-17■■■■■ 28.6
DKC1O60832 BMS1P1-202ENST00000580094 4294 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.745e-17■■■■■ 28.6
DKC1O60832 TET3-202ENST00000409262 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.765e-17■■■■■ 28.6
DKC1O60832 GIT2-218ENST00000551721 2362 ntTSL 59.09□□□□□ -0.955e-17■■■■■ 28.6
DKC1O60832 CABIN1-206ENST00000454754 1321 ntTSL 1 (best)22.47■■□□□ 1.199e-13■■■■■ 28.6
DKC1O60832 CABIN1-205ENST00000445422 1472 ntTSL 221.67■■□□□ 1.069e-13■■■■■ 28.6
DKC1O60832 CARD10-210ENST00000494166 560 ntTSL 523.03■■□□□ 1.282e-6■■■■■ 28.6
DKC1O60832 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.792e-6■■■■■ 28.6
DKC1O60832 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 28.6
DKC1O60832 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.41e-6■■■■■ 28.5
DKC1O60832 EHBP1-220ENST00000496857 1262 ntTSL 1 (best)12.37□□□□□ -0.433e-10■■■■■ 28.5
DKC1O60832 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.995e-8■■■■■ 28.4
DKC1O60832 PTPRU-203ENST00000415600 1590 ntTSL 523■■□□□ 1.271e-6■■■■■ 28.4
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