Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8444F6XS56 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8444F6XS56 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms