Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1iE9Q7P2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1iE9Q7P2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms