Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trappc8E9PWG2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trappc8E9PWG2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trappc8E9PWG2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 519.6 ms