Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp42B2RQC2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp42B2RQC2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms