Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRIQ3A6PVS8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ3A6PVS8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms