Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdc27A2A6Q5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdc27A2A6Q5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms