Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCN11AQ9UI33 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCN11AQ9UI33 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms