Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Plod3Q9R0E1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Plod3Q9R0E1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms