Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWT9

Kifc1, Kinesin-like protein KIFC1, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifc1Q9QWT9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kifc1Q9QWT9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kifc1Q9QWT9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kifc1Q9QWT9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kifc1Q9QWT9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kifc1Q9QWT9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kifc1Q9QWT9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kifc1Q9QWT9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kifc1Q9QWT9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Kifc1Q9QWT9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kifc1Q9QWT9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kifc1Q9QWT9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kifc1Q9QWT9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kifc1Q9QWT9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kifc1Q9QWT9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kifc1Q9QWT9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kifc1Q9QWT9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kifc1Q9QWT9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kifc1Q9QWT9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kifc1Q9QWT9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kifc1Q9QWT9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kifc1Q9QWT9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kifc1Q9QWT9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kifc1Q9QWT9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kifc1Q9QWT9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms