Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC4BQ9NT99 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC4BQ9NT99 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms