Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bgrlQ9JJU8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.9 ms