Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Bco1Q9JJS6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Bco1Q9JJS6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Bco1Q9JJS6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Bco1Q9JJS6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bco1Q9JJS6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Bco1Q9JJS6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Bco1Q9JJS6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Bco1Q9JJS6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Bco1Q9JJS6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bco1Q9JJS6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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