Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Swt1Q9DBQ9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Swt1Q9DBQ9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms