Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Krt34Q9D646 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt34Q9D646 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt34Q9D646 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt34Q9D646 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Krt34Q9D646 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt34Q9D646 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt34Q9D646 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms