Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc96Q9CR92 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc96Q9CR92 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms