Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rnf17Q99MV7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rnf17Q99MV7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Rnf17Q99MV7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms