Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlgn1Q99K10 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlgn1Q99K10 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms