Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC47Q96A33 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC47Q96A33 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms