Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnf144aQ925F3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.3 ms