Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrdQ8K2M3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrdQ8K2M3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrdQ8K2M3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrdQ8K2M3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrdQ8K2M3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrdQ8K2M3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrdQ8K2M3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrdQ8K2M3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrdQ8K2M3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrdQ8K2M3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrdQ8K2M3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrdQ8K2M3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrdQ8K2M3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrdQ8K2M3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrdQ8K2M3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrdQ8K2M3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrdQ8K2M3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrdQ8K2M3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrdQ8K2M3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrdQ8K2M3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrdQ8K2M3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrdQ8K2M3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrdQ8K2M3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrdQ8K2M3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrdQ8K2M3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrdQ8K2M3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrrdQ8K2M3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrdQ8K2M3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms